En la elaboración de las líneas de investigación han participado los docentes de la Maestría en Ingeniería Informática a la invitación realizada por la coordinación para formar parte de un equipo de trabajo teniendo en cuenta su experiencia y vinculación a la investigación en temas relacionados a esta Maestría. Entre las Líneas de investigación se encuentran: 

1. Área de Ciencias de la Computación y Tecnologías de Información

• Inteligencia Artificial.
• Inteligencia de Negocios.
• Administración del conocimiento.
• Infraestructura y plataforma de servicios
• Optimización de procesos empresariales.

2. Ingeniería de software

• Calidad de Software.
• Metodologías del Software.
• Gestión de Proyectos de Software.
• Aspectos relacionados con el factor humano y ergonomía.
• Innovación y desarrollo tecnológico.