El laboratorio de epidemiología molecular se encuentra implementado con características de un laboratorio BSL-2 y está orientado a investigaciones en diagnóstico molecular, estudios poblacionales de patógenos y de resistencia a drogas utilizando tecnología de punta. El principal objetivo es implementar herramientas moleculares para la vigilancia, control y eliminación de enfermedades crónicas e infecciosas de importancia nacional y regional. Además, se cuenta con un área de bioinformática para un correcto análisis e interpretación de resultados genómicos.

El laboratorio de biotecnología cuenta con equipos especializado para implementar trabajos que puedan lograr la identificación de biomarcadores para detección temprana de cáncer y enfermedades crónicas. Por otro lado, se cuenta con proyectos de investigación orientados a la producción de péptidos y proteínas para diagnóstico de enfermedades, así como para estudio de candidatos a vacunas.